MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 1442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011981	AGC	2	6	426947	426952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011981	TCT	2	6	426996	427001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011981	GCG	2	6	427165	427170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011981	CCT	2	6	427311	427316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_011981	CGAC	2	8	427340	427347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_011981	TCG	2	6	427428	427433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011981	GCCT	2	8	427475	427482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_011981	TGG	2	6	427578	427583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011981	GTCT	2	8	427653	427660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_011981	CCT	2	6	427681	427686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_011981	TGG	2	6	427687	427692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011981	GAT	2	6	430552	430557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011981	TGA	2	6	430587	430592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011981	GGA	2	6	430608	430613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011981	CA	3	6	430643	430648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_011981	CAA	2	6	430659	430664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_011981	ATGCC	2	10	431353	431362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_011981	ACA	2	6	431415	431420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011981	CCG	3	9	431426	431434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_011981	ATC	2	6	431435	431440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011981	CAC	2	6	431463	431468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_011981	TCAA	2	8	431488	431495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_011981	TTGA	2	8	431614	431621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011981	AG	3	6	431628	431633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011981	CGC	2	6	431663	431668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_011981	A	6	6	431674	431679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011981	TCT	2	6	431683	431688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011981	ACA	2	6	444754	444759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_011981	CGG	2	6	444772	444777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011981	GT	3	6	448464	448469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011981	GC	3	6	448505	448510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_011981	GCC	2	6	448541	448546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_011981	CGC	2	6	448602	448607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_011981	CCG	2	6	448629	448634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_011981	TTC	3	9	448647	448655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011981	TTG	2	6	448682	448687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011981	TGG	2	6	448696	448701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011981	GGC	2	6	448772	448777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011981	ACA	2	6	448802	448807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_011981	TTC	2	6	448816	448821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011981	AGA	2	6	448832	448837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011981	GGC	2	6	448845	448850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_011981	CAG	2	6	448872	448877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011981	CGA	2	6	448983	448988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011981	ATC	2	6	449010	449015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011981	TCC	2	6	449085	449090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_011981	CAA	2	6	449237	449242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011981	A	6	6	449287	449292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011981	TTC	2	6	449324	449329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011981	TAG	2	6	449425	449430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011981	ACA	2	6	450431	450436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011981	TGT	2	6	450444	450449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011981	TCC	2	6	451308	451313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_011981	CTC	2	6	451361	451366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_011981	GCC	2	6	451377	451382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_011981	GCAA	2	8	451387	451394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_011981	TCGCTC	2	12	451410	451421	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_011981	GCG	2	6	451533	451538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011981	GCC	2	6	451543	451548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_011981	CTG	2	6	451675	451680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011981	CG	3	6	452523	452528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011981	AGGTC	2	10	452541	452550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_011981	GCA	2	6	452613	452618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011981	GCA	2	6	452621	452626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011981	ATAA	2	8	452700	452707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011981	TTA	3	9	452714	452722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011981	ACA	2	6	452780	452785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011981	GTA	2	6	452791	452796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011981	CCT	2	6	453797	453802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_011981	TGC	2	6	453811	453816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_011981	TCGA	2	8	453817	453824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_011981	GC	4	8	453852	453859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_011981	GAC	2	6	453903	453908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_011981	AAT	2	6	453991	453996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011981	ATCC	2	8	454030	454037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_011981	AGA	2	6	454092	454097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011981	AAC	2	6	454109	454114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011981	TGA	2	6	454124	454129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011981	TGAATC	2	12	454237	454248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1080	NC_011981	CGG	2	6	454321	454326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011981	ACG	2	6	454359	454364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_011981	GGAA	2	8	455302	455309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011981	ACC	2	6	457101	457106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_011981	AG	3	6	457150	457155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011981	TTG	2	6	457993	457998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011981	GGC	2	6	460223	460228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011981	CCG	2	6	460233	460238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_011981	TCTGT	2	10	460305	460314	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1089	NC_011981	CAA	2	6	460327	460332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011981	CGCAG	2	10	460346	460355	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1091	NC_011981	TTG	2	6	460370	460375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011981	GAA	2	6	460383	460388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011981	ATT	2	6	460396	460401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011981	AAT	2	6	460405	460410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011981	GAA	2	6	460414	460419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011981	AAAAT	2	10	460959	460968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011981	TAA	2	6	460982	460987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011981	TTGC	2	8	461189	461196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_011981	GTT	2	6	461211	461216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011981	ATCG	2	8	461232	461239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_011981	GAC	2	6	461241	461246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011981	ATC	2	6	461324	461329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011981	CAG	2	6	461635	461640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_011981	AG	4	8	461670	461677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011981	CCG	2	6	461761	461766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_011981	GCT	2	6	461784	461789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_011981	ACTAC	2	10	461829	461838	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1108	NC_011981	AGC	2	6	461857	461862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011981	GCC	2	6	461869	461874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_011981	AAC	2	6	461889	461894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_011981	TCT	2	6	461915	461920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_011981	AAG	2	6	461921	461926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011981	GCC	2	6	461927	461932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_011981	A	6	6	462071	462076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011981	ATC	2	6	462126	462131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011981	GAAT	2	8	462137	462144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011981	TCC	2	6	462209	462214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_011981	A	6	6	462215	462220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011981	CAT	2	6	468841	468846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011981	CAG	2	6	468852	468857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_011981	AAC	2	6	471974	471979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_011981	GA	3	6	471987	471992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011981	TTG	2	6	472059	472064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011981	GAGT	2	8	472111	472118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011981	TTC	2	6	472170	472175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011981	CA	3	6	472193	472198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_011981	AAAC	2	8	472227	472234	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_011981	A	6	6	474238	474243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011981	GGT	2	6	474257	474262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011981	GGTTC	2	10	475947	475956	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_011981	GAGC	2	8	486348	486355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_011981	AGA	2	6	486398	486403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011981	CGGCG	2	10	486440	486449	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1134	NC_011981	CG	3	6	486456	486461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_011981	C	9	9	486511	486519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1256	NC_011981	ATG	2	6	553358	553363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_011981	CAG	2	6	553396	553401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1260	NC_011981	AAC	2	6	558467	558472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_011981	GAC	2	6	559023	559028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1406	NC_011981	GC	3	6	617268	617273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1407	NC_011981	CCG	2	6	617302	617307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1408	NC_011981	ACG	2	6	618882	618887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_011981	CCTC	2	8	618913	618920	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1410	NC_011981	GCC	2	6	618924	618929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_011981	CTC	2	6	618932	618937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_011981	GGC	2	6	618940	618945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_011981	CCTC	2	8	620075	620082	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1414	NC_011981	AAT	2	6	620148	620153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_011981	CGGCG	2	10	620157	620166	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1416	NC_011981	AGG	2	6	620183	620188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_011981	CAA	2	6	620208	620213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_011981	TGT	2	6	625570	625575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_011981	TTG	2	6	625630	625635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_011981	CGA	2	6	625685	625690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1421	NC_011981	GGC	2	6	625857	625862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_011981	CCG	2	6	625879	625884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1423	NC_011981	CAA	2	6	625903	625908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_011981	AGTC	2	8	625909	625916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1425	NC_011981	GAA	3	9	625930	625938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_011981	GTT	2	6	626958	626963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_011981	T	8	8	626962	626969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_011981	TG	3	6	626978	626983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_011981	A	6	6	627005	627010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_011981	ATC	2	6	627029	627034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_011981	CAC	2	6	628715	628720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1432	NC_011981	TA	3	6	628735	628740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_011981	TG	3	6	628902	628907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_011981	TCC	2	6	628937	628942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1435	NC_011981	CGT	2	6	628956	628961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_011981	TCG	2	6	629045	629050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_011981	GCA	2	6	630117	630122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1438	NC_011981	CTT	2	6	631308	631313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1439	NC_011981	CA	3	6	631431	631436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1440	NC_011981	CGA	2	6	631470	631475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_011981	AG	3	6	631567	631572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_011981	AAC	2	6	631617	631622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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